MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013862	T	6	6	28972	28977	0 %	100 %	0 %	0 %	288986965
502	NC_013862	T	6	6	28980	28985	0 %	100 %	0 %	0 %	288986965
503	NC_013862	T	6	6	29022	29027	0 %	100 %	0 %	0 %	288986965
504	NC_013862	CGC	2	6	29066	29071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986965
505	NC_013862	GTC	2	6	29077	29082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986965
506	NC_013862	T	6	6	29088	29093	0 %	100 %	0 %	0 %	288986965
507	NC_013862	TAA	2	6	29103	29108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986965
508	NC_013862	T	6	6	29150	29155	0 %	100 %	0 %	0 %	288986965
509	NC_013862	TTA	2	6	29159	29164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288986965
510	NC_013862	TGT	2	6	29176	29181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986965
511	NC_013862	CAT	3	9	29244	29252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986965
512	NC_013862	GCT	2	6	29289	29294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986965
513	NC_013862	CTG	2	6	29344	29349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986965
514	NC_013862	CTTTT	2	10	29435	29444	0 %	80 %	0 %	20 %	288986965
515	NC_013862	CAC	2	6	29496	29501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986965
516	NC_013862	TAAA	2	8	29514	29521	75 %	25 %	0 %	0 %	288986965
517	NC_013862	AGT	2	6	29539	29544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986965
518	NC_013862	AAC	2	6	29557	29562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986965
519	NC_013862	T	6	6	29565	29570	0 %	100 %	0 %	0 %	288986965
520	NC_013862	TTC	2	6	29575	29580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986965
521	NC_013862	TAAC	2	8	29669	29676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_013862	CAT	2	6	29791	29796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986966
523	NC_013862	T	6	6	29825	29830	0 %	100 %	0 %	0 %	288986966
524	NC_013862	TAA	2	6	29851	29856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986966
525	NC_013862	CTA	2	6	29860	29865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986966
526	NC_013862	GCC	2	6	29871	29876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986966
527	NC_013862	TCA	2	6	29910	29915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986966
528	NC_013862	ATTGA	2	10	30008	30017	40 %	40 %	20 %	0 %	288986966
529	NC_013862	CCT	2	6	30151	30156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288986966
530	NC_013862	ACC	2	6	30230	30235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986966
531	NC_013862	GCC	2	6	30248	30253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986966
532	NC_013862	ACC	3	9	30266	30274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986966
533	NC_013862	GTTG	2	8	30293	30300	0 %	50 %	50 %	0 %	288986966
534	NC_013862	TGA	2	6	30317	30322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986966
535	NC_013862	ACC	2	6	30362	30367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986966
536	NC_013862	CAA	2	6	30409	30414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986966
537	NC_013862	T	6	6	30457	30462	0 %	100 %	0 %	0 %	288986966
538	NC_013862	GAA	2	6	30523	30528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986966
539	NC_013862	T	7	7	30581	30587	0 %	100 %	0 %	0 %	288986966
540	NC_013862	TCA	2	6	30627	30632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986966
541	NC_013862	T	8	8	30640	30647	0 %	100 %	0 %	0 %	288986966
542	NC_013862	CGT	2	6	30709	30714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986966
543	NC_013862	T	6	6	30719	30724	0 %	100 %	0 %	0 %	288986966
544	NC_013862	AGC	2	6	30734	30739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986966
545	NC_013862	AGC	2	6	30749	30754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986966
546	NC_013862	TAA	2	6	30784	30789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013862	TAGC	2	8	30800	30807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_013862	CGC	2	6	30832	30837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_013862	ATC	2	6	30847	30852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013862	T	7	7	30853	30859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013862	AGC	2	6	30982	30987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013862	GC	3	6	31223	31228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_013862	ATT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013862	TGG	2	6	31295	31300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013862	CAC	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_013862	CAA	2	6	31342	31347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013862	GTA	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013862	GCT	2	6	31377	31382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986967
559	NC_013862	CT	3	6	31381	31386	0 %	50 %	0 %	50 %	288986967
560	NC_013862	CAC	2	6	31408	31413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986967
561	NC_013862	CGT	2	6	31419	31424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986967
562	NC_013862	CGG	2	6	31501	31506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986967
563	NC_013862	TG	3	6	31583	31588	0 %	50 %	50 %	0 %	288986967
564	NC_013862	CACCT	2	10	31665	31674	20 %	20 %	0 %	60 %	288986968
565	NC_013862	C	6	6	31685	31690	0 %	0 %	0 %	100 %	288986968
566	NC_013862	TCC	2	6	31768	31773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288986968
567	NC_013862	CTC	2	6	31812	31817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288986968
568	NC_013862	GGC	2	6	31821	31826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986968
569	NC_013862	TCA	2	6	31829	31834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986968
570	NC_013862	TTA	2	6	31968	31973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013862	CAA	2	6	31977	31982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_013862	TCG	2	6	32129	32134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013862	CCA	2	6	32154	32159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_013862	GCG	2	6	32179	32184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986969
575	NC_013862	ATG	2	6	32193	32198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986969
576	NC_013862	GAC	2	6	32201	32206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986969
577	NC_013862	ACA	2	6	32215	32220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986969
578	NC_013862	GCC	2	6	32272	32277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986969
579	NC_013862	GTT	2	6	32425	32430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013862	AAT	2	6	32435	32440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013862	CGA	2	6	32586	32591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013862	CCA	2	6	32661	32666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986970
583	NC_013862	CGT	2	6	32673	32678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986970
584	NC_013862	TC	3	6	32686	32691	0 %	50 %	0 %	50 %	288986970
585	NC_013862	GACA	2	8	32706	32713	50 %	0 %	25 %	25 %	288986970
586	NC_013862	GCT	2	6	32857	32862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986970
587	NC_013862	CAC	2	6	32923	32928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986970
588	NC_013862	GCC	2	6	32949	32954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986970
589	NC_013862	GTGC	2	8	32958	32965	0 %	25 %	50 %	25 %	288986970
590	NC_013862	GAT	2	6	32969	32974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986970
591	NC_013862	GAT	2	6	33002	33007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986970
592	NC_013862	TCCCC	2	10	33046	33055	0 %	20 %	0 %	80 %	288986970
593	NC_013862	ATG	2	6	33066	33071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986970
594	NC_013862	CCA	3	9	33109	33117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986970
595	NC_013862	CAG	2	6	33191	33196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986970
596	NC_013862	CGC	2	6	33266	33271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986970
597	NC_013862	GGCC	2	8	33301	33308	0 %	0 %	50 %	50 %	288986970
598	NC_013862	ACCG	2	8	33428	33435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_013862	GTTT	2	8	33469	33476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013862	TTTG	2	8	33498	33505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013862	TCGA	2	8	33790	33797	25 %	25 %	25 %	25 %	288986971
602	NC_013862	AAG	2	6	33862	33867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986971
603	NC_013862	GCA	2	6	33902	33907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986971
604	NC_013862	AGA	2	6	33935	33940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986971
605	NC_013862	GAA	2	6	33990	33995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986971
606	NC_013862	GCA	2	6	34019	34024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986971
607	NC_013862	CAG	2	6	34074	34079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986971
608	NC_013862	GAC	2	6	34091	34096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986971
609	NC_013862	GCA	2	6	34103	34108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986971
610	NC_013862	CG	3	6	34145	34150	0 %	0 %	50 %	50 %	288986971
611	NC_013862	AGG	2	6	34153	34158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288986971
612	NC_013862	CTG	2	6	34361	34366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013862	GA	3	6	34412	34417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013862	GC	3	6	34518	34523	0 %	0 %	50 %	50 %	288986972
615	NC_013862	TGGC	2	8	34563	34570	0 %	25 %	50 %	25 %	288986972
616	NC_013862	CCG	2	6	34653	34658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986972
617	NC_013862	GAC	2	6	34740	34745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986972
618	NC_013862	ATG	2	6	34756	34761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986972
619	NC_013862	CATTC	2	10	34766	34775	20 %	40 %	0 %	40 %	288986972
620	NC_013862	ATC	2	6	34810	34815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986973
621	NC_013862	GACG	2	8	34914	34921	25 %	0 %	50 %	25 %	288986973
622	NC_013862	GTC	2	6	34982	34987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986973
623	NC_013862	ACCT	2	8	35017	35024	25 %	25 %	0 %	50 %	288986973
624	NC_013862	AGA	2	6	35046	35051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986973
625	NC_013862	CGG	2	6	35135	35140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986973
626	NC_013862	TGAAT	2	10	35184	35193	40 %	40 %	20 %	0 %	288986973
627	NC_013862	ACA	2	6	35230	35235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013862	A	7	7	35307	35313	100 %	0 %	0 %	0 %	288986974
629	NC_013862	CGAT	2	8	35317	35324	25 %	25 %	25 %	25 %	288986974
630	NC_013862	T	6	6	35333	35338	0 %	100 %	0 %	0 %	288986974
631	NC_013862	AAT	2	6	35364	35369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986974
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